中国麻醉史馆位于医学博物馆三层，展馆面积1500平方米，馆藏展品达4000余件。

中国麻醉史馆是医学博物馆三个分馆中规模最大、馆藏数量最多、也最为丰富的主题馆。内容涵盖中国古代麻醉文化、中国近代麻醉人物志、麻醉器械与药品、书籍手稿等珍贵资料，并专门开辟全国各省市麻醉发展历程展区，全面展示中国麻醉发展历史。